La DATAR a participé à la définition d'une nouvelle politique en faveur d'un développement équilibré du littoral, basé sur une approche globale et partenariale (voir les décisions du CIADT du 14 septembre 2004).
Dans ce cadre, elle a lancé en 2005 avec le Secrétariat général à la mer un appel à projet pour un développement équilibré des territoires littoraux par une gestion intégré des zones côtières. Son objectif : encourager des expérimentations de terrain autour de projets concrets ; faire émerger des pratiques et des méthodes adaptées aux besoins des territoires littoraux et aux volontés locales. Les projets devaient s'inscrire dans le cadre général d’une gestion intégrée des zones côtières telle qu’elle a été définie par la recommandation européenne de gestion intégrée des zones côtières - GIZC- du 30 mai 2002). Un rapport présentant le bilan de la mise en œuvre en France d’une stratégie de gestion intégrée des zones côtières, a été adressé à Bruxelles en mai 2006.
La DATAR assure, par ailleurs, le secrétariat du Conseil national du littoral (CNL)